Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms