Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms