Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem53Q9D0Z3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmem53Q9D0Z3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem53Q9D0Z3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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