Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Elp3Q9CZX0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Elp3Q9CZX0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms