Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shmt2Q9CZN7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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