Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG9

Pdzd11, PDZ domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd11Q9CZG9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pdzd11Q9CZG9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzd11Q9CZG9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms