Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ChtopQ9CY57 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms