Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Exo5Q9CXP9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Exo5Q9CXP9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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