Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms