Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rhobtb3Q9CTN4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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