Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms