Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm4sf20Q9CQY8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tm4sf20Q9CQY8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms