Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms