Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rdm1Q9CQK3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdm1Q9CQK3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms