Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nup155Q99P88 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nup155Q99P88 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nup155Q99P88 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nup155Q99P88 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nup155Q99P88 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nup155Q99P88 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup155Q99P88 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms