Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl43Q99N89 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms