Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hdac9Q99N13 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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