Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tdrd1Q99MV1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd1Q99MV1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms