Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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