Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gdpd3Q99LY2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gdpd3Q99LY2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms