Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apobec3Q99J72 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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