Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Csmd1Q923L3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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