Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Afg3l1Q920A7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Afg3l1Q920A7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms