Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usb1Q91W78 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usb1Q91W78 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usb1Q91W78 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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