Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smg8Q8VE18 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smg8Q8VE18 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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