Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms1Q8VCQ6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sgms1Q8VCQ6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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