Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxapQ8VCG9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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