Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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