Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hecw1Q8K4P8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms