Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pitrm1Q8K411 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms