Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OptnQ8K3K8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms