Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms