Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ssh3Q8K330 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms