Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms