Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms