Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Hpf1Q8CFE2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hpf1Q8CFE2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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