Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup88Q8CEC0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms