Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Atg4aQ8C9S8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4aQ8C9S8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Atg4aQ8C9S8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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