Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Q8C708 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q8C708 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q8C708 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms