Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ClmnQ8C5W0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms