Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ssuh2Q8C3L1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ssuh2Q8C3L1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ssuh2Q8C3L1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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