Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trim35Q8C006 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim35Q8C006 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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