Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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