Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pggt1bQ8BUY9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms