Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TicrrQ8BQ33 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms