Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tubgcp5Q8BKN5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubgcp5Q8BKN5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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