Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp1Q8BJQ2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms