Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdca8Q8BHX3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms