Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms