Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms